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【DS应用实例】达索系统Jodi Shaulsky与C4 Therapeutics药物公司的成果展示: 目标蛋白质降解
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【DS应用实例】达索系统Jodi Shaulsky与C4 Therapeutics药物公司的成果展示: 目标蛋白质降解

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Discovery Studio

Targeted Protein Degradation with Discovery Studio

设计治疗方法的新策略并不经常出现,而靶向蛋白降解(TPD)就是最近才出现的新策略之一。我们的客户C4 Therapeutics正在积极开发这项技术。

 

该公司表示:

靶向蛋白质降解利用细胞的固有能力来控制蛋白质水平,以消除已知的疾病驱动因素。

 

TPD方法标记要破坏的蛋白质,通常使用所谓的降解分子。该过程是基于中间三元复合体目标降解连接酶的生成。目标降解连接酶通过一种被称为泛素化的自然细胞过程导致蛋白质的破坏。降解物不同于抑制剂,它们实际上破坏目标蛋白而不是限制其活性。

 

Quick Insights

C4 Therapeutics与BIOVIA公司的Jodi Shaulsky最近发表的一篇论文结合了实验和计算工具,提供了一种工作流程,可快速了解降解诱导的蛋白质在溶液中的界面结构。

 

使用氘氢交换质谱和计算建模的降解诱导三元配合物的结构表征:基于结构的设计,此文章发表在ACS化学生物学杂志上。

 

Discovery Studio的CHARMm被用于包装蛋白质降解复合物,并使用蛋白质结合ZRANK对它们进行互补。这项工作为TPD研究创建了一个有趣的模板,例如使用PROTAC方法学。

 

本文翻译自Dassault Systèmes Bolg, 点击“阅读原文” ,访问原文英文链接。

 

公司简介:

北京泰科博思科技有限公司(Beijing Tech-Box S&T Co. Ltd.)成立于2007年,是国内领先的分子模拟及虚拟仿真综合解决方案提供商。

 

北京泰科博思科技有限公司与国际领先的模拟软件厂商、开发团队深入合作,为高校、科研院所和企业在材料、化工、药物、生命科学、环境、人工智能及数据挖掘、虚拟仿真教学等领域提供专业的整体解决方案。用户根据需要在我们的平台上高效的进行各种模拟实验,指导实际的生产设计。

 

北京泰科博思科技有限公司拥有一支一流的技术服务团队和资深的专家咨询团队,以客户真正需求出发,服务客户,为客户创造价值。我们秉承“职业、敬业、担当、拼搏、合作”的企业精神,致力于用国际领先的软件产品和专业全面的技术支持服务,成为客户可信赖的合作伙伴。 

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