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产品名称

Pipeline Pilot

PipelinePilot——强大的信息整合和流程定制软件 PipelinePilot是法国达索系统公司BIOVIA旗下用于信息整合和流程定制的软件,是一款功能强大的信息整合和流程定制的科学平台。它在优化研究创新周期、提高工作效率与减少研究经费和IT经费方面能发挥巨大作用。通过PipelinePilot,用户不仅能够整合和挖掘杂乱无章的海量研究数据,自动化数据的分析流程,而且还可以实现企业级的研究成果快速分析、可视化与共享,并提升大范围的协作能力。 BIOVIAPipelinePilot通过科学数据分析功能(绿色部分)和允许自动和标准化处理数据、重复数据准备和验证服务(蓝色部分),从而实现优化研发创新的循环周期。使得科学家和工程师们能够集中精力,将他们的知识和能力投入到真正具有创新意义的工作上。BIOVIAPipelinePilot适用于制药、生物技术、材料科学、个人消费品、石油、天然气、汽车、航空航天、能源和国防等多个领域。  PipelinePilot能够图形化地定制符合您的要求的数据管理和信息挖掘等科研工作流程。PipelinePilot中包含了超过上千个各种功能的组建(Components),您可以根据自己的需求,将其组合成不同的数据处理流程协议(Protocols),实现各种复杂功能,如数据检索和处理,化合物各种性质的计算、筛选与显示等。PipelinePilot平台还提供了WEB服务层接口,允许您将建立的数据处理流程部署在服务器端上,通过WEB向外界提供服务。PipelinePilot拥有强大的数据处理引擎和灵活的构架,这使得它能完美地解决研发机构面临的众多难题。 功能概览·PipelinePilot具有以下功能:-对文本、数字和包括化学结构、生物序列和科学图像在内的复杂数据结构进行数据管理、分析和生成报告。-快速的应用开发环境,它帮助收集用户需求并将之模型化,从而直接形成一个最终的产品系统。-提供可用于数据检索、处理、过滤和显示的可配置组件。-使用标准技术来构建自定义组件,这些标准技术包括SOAP/WEBSERVICES、Perl、JAVA和命令行范式。-提供一个灵活的、可配置的、面向服务的架构。-提供大量已由实践检验的科学组件和最佳工作流,这些组件和工作流涵盖了众多的科学领域。-能够整合第三方应用程序、数据库和已有的常用科学工具,包括微软SHAREPOINT、微软OFFICE应用程序、化学制品注册数据库、图像数据管理系统、在线数据库(如PUBME何PUBCHEM)、专利数据库、RCSB(生物序列数据库)。PipelinePilot的开放式架构使得它能够整合大量其它的第三方数据资源,包括ODBC、JDBC或网络服务兼容的那些资源。 ·灵活的数据与应用程序整合能力PipelinePilot通过一系列的标准化技术,能帮助您将各种不同格式的数据,如内部数据库,文档或任何从企业中获得的数据组织成统一有序的信息,为您的决策提供有力依据。对于科研工作者,PipelinePilot还可以读取各种通用格式的化学、生物序列、文本、图像和数字信息并对它们进行实时的分析。同时,通过SOAP、PERL、JAVA、VBSCRIPT和命令行等方式,研究人员可以把工作相关的第三方软件整合成为新的组件,建立更符合自己科研型和要求的数据处理流程,这些新组件将被自动整合为系统模块组件的一部分,能以系统原有组件相同的方式与其他用户共享使用。 ·最佳流程的共享和部署能力在PipelinePilot中,可以对数据处理流程实现自动获取,注释和版本编号,还可以方便地将建立的数据处理流程发布给其他研究人员,使得团队合作开发变得更加方便。未来进行更广泛的交流,您甚至可以将您的数据处理流程通过PipelinePilot的WEB接口发布到网络上,提供基于浏览器的使用方式,供更多人的交流和使用。 ·可定制的报告和网络应用的开发能力在PipelinePilot中,可以使用表格、图表、图片和文字等定制数据报告,对数据分析和数据挖掘过程进行总结和展示,并按照您的意愿设计合适的报告布局和报告内容,从而更深入地解释所获得的结果。您在同一张报告中使用表格、图表和图像,可以从不同的视角上观察同一份数据,或使用不同的方式对不同来源的数据进行相互比较,从而得出合理的结论,为最终决策提供依据。您还可以使用多种格式输出报告,包括HTML、PDF、WORD和POWERPOINT。 未来让您的报告更加生动,您可以在其中加入WEB交互元素,如报告内加入超链接,各种信息提示等。您甚至可以将几个数据处理流程整合成为一个网络应用程序,由最终用户来决定显示哪些数据和用哪种方式来显示数据,而不需要最终用户设计任何数据处理流程。
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产品简介
应用领域
主要功能

BIOVIA Pipeline Pilot—强大的信息整合和流程定制软件

 

BIOVIA Pipeline Pilot是一个科学智能的分析平台,提供了上千个分析组件,涉及生物、制药、化工、材料等多个学科和领域。它以图形化的形式,让用户可以像搭积木一样将各个科学组件组合成各种分析流程,从而来完成复杂科学数据的自动处理。它在优化研究创新周期、提高工作效率与减少研究经费方面能发挥巨大作用。

主要特点

 

MAIN FEATURE

强大的数据处理能力

Pipeline Pilot能够图形化地定制符合您的要求的数据管理和信息挖掘等科研工作流程。可以根据需求实现如数据检索和处理,化合物各种性质的计算、筛选与显示等功能。

灵活的数据与应用程序整合能力

通过系列的标准化技术,可以分析不同格式的数据,甚至是化学、生物序列、文本、图像和数字信息。同时,可以把工作相关的第三方软件整合成为新的组件,建立更符合自己科研习惯和要求的数据处理流程。

最佳流程的共享和部署能力

在Pipeline Pilot中,可以对数据处理流程实现自动获取,注释和版本编号,还可以方便地将建立的数据处理流程分享给其他研究人员。

定制的报告和网络应用的开发能力

在Pipeline Pilot中,可以使用表格、 图表、 图片和文字等定制数据报告,对数据分析和数据挖掘过程进行总结和展示,并按照自己意愿设计合适的报告布局和报告内容,从而更深入地解释所获得的结果。

灵活的系统架构和客户端类型

Pipeline Pilot采用灵活的系统架构,其服务端支持Windows 和Linux平台,并可以按Client / Server (客户端/服务器)和Browse / Server (浏览器/服务器)两种模式来部署,使得各流程和任务能够方便地跨平台运行。

拓展和提升Biovia应用程序

Pipeline Pilot可以用于扩展和提升各种Biovia应用程序的能力,如Insight,Materials Studio等。大部分Biovia应用程序都提供有相应的接口,使得Pipeline Pilot可以为其提供自动化工作流程。

未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

BIOVIA Pipeline Pilot

 

Pipeline Pilot既支持简单的数据格式(文本和数字),又支持复杂的科学数据类型(图像、化学结构和生物序列),再加上Biovia应用的接口,使得Pipeline Pilot能够满足众多领域的各种需求。

应用领域

 

APPLICATION FIELD

制药

生物技术

材料科学

个人消费品

石油天然气

汽车

航空航天

国防

BIOVIA Pipeline Pilot

 

Pipeline Pilot组件是构成科学信息平台的—个个 “积木”,它们被按照科学领域或功能进行分类。研究人员、开发人员和 IT专家通过这些大量的组件执行特定的科学分析,也可以进行常见的数据处理。他们以可视化的方式搭建分析流程,从而实现数据检索、筛选、分析和生成报告等功能。

主要功能

 

THE MAIN FUNCTION

Materials Studio

 

Chemistry化学

● Chemistry模块提供了多种对化合物的筛选和学习方法,实现化合物的性质计算、分析和处理等功能。可以快速枚举和分析组合化学的反应产物,识别一系列化合物中的公共子结构。该模块支持绝大多数的工业标准化学格式,并可实现各种格式之间的转化。

● ADMET模块能够计算化合物在生物体内的吸收、分布、代谢、排泄和毒性特征,包含的模型有:人体肠内吸收预测模型、水溶性预测模型、血脑障碍渗透性预测模型、血浆蛋白结合率预测模型、细胞色素P450 2D6抑制率预测模型和肝毒性预测模型,此外,还能够预测已知药物的代谢产物。

Materials Studio

 

Biology生物

● Gene Expression模块在开源软件BioConductor的基础上,实现了基因表达实验的数据处埋、可视化、分析、标记和报告生成等系列功能。

● Sequence Analysis模块通过

180多种的序列分析组件提供了整套的生物信息学工具,将模块化工具与图形化的设计方式结合,实现对蛋白质和核酸的序列的注释和特征分析,序列搜索和比对,产生引物和扩增子,siRNA设计,发现限制性酶切位点等功能。

● Mass Spec for Proteomics模块提供了—系列对基于生物质谱的蛋白组数据处理工具,可以对来自质谱实验的数据进行读入、输出、显示、处理、分析、比较和发布。

● Next Generation

Sequencing(NGS)模块让用户能够分析和解析目前大多数高通量测序仪产生的大量数据集。

Materials Studio

 

Imaging图像处理

● 图像处理模块大大改变了企业处理图像信息的方式,它不仅应用范围广泛,且简单易用。它能够对图像进行全面、 准确的分析,且能够与其他相关数据关联起来,从而为研究人员和决策者提供更及时准确的决策依据。 该模块提供了图像数据的增强、处理、分析、数—据整合、数据管理、检索和报告输出的全面的综合科学图像分析工具,能够将图像数据与数值、文本、化学及其他科学数据整合在一个统一的工作平台进行分析。

Materials Studio

 

Laboratory实验室数据分析

● Plate Data Analytics模块提供了对孔板数据的读、写、报告、可视化、操作和计算等功能,数据处理流程中的每条数据记录都能够对孔板上的单孔数据或整版数据进行处理。

● Analytical Instrumentation模块提供对实验室中分析谱图数据的获取和处理。使用该模块,可以对分析谱图数据自动处理、产生报告,并且与其他部门共享。

● Mobile移动应用模块使

Pipeline Pilot具备了通过移动终端即时访问数据和信息的能力通过ScienceCloud Task App ,终端用户可以通过iPhone或者ipad以简单易懂的方式来调用功能强大的Pipeline Pilot protocols。

Materials Studio

 

Life Science Modeling & Simulation

生命科学建模和模拟

● Catalyst Collection提供了整套药效团建模和3D分子数据库筛选工具。

Pipeline Pilot整合了著名的药效团软件

Catalyst,从而简化了药效团的建模和分析过程。

● CHARMm Collection模块整合著名的分子动力学引擎CHARMm,可以用来模拟生物分子,能为蛋白质、核酸、小分子和蛋白质配体复合物进行稳定而又准确的分子动力学模拟。

Materials Studio

 

Materials Modeling & Simulation

材料模拟

● Pipeline Pilot中的Materials Studio (MSC)模块,集成并支持Materials

Studio (MS)中主要的建模和模拟工具,可以为材料研究的预测分析和自动化工作流程提供完整的软件解决方案。与传统的材料模拟不同的是,通过Pipeline Pilot,复杂的工作流程能够被轻松迅速的开发、记录和共享。

● 高分子性质(Synthia)模块提供了一系列方法,可以基于重复单元信息、分子量和温度,对无定型聚合物和随机共聚物的性质进行快速预测。

Materials Studio

 

Reporting & Visualization

报告和可视化

● Reporting模块为数据分析和挖掘工作定制总结报告。报告中可灵活使用表格、图表、图像和文字等各种元素,并通过对报告布局和报告内容的调整,能更清晰地解释和阐述所获得的结果。通过在张报告内展示多种不同的表格、图表和图像,可以在不同视角上观察同份数据,或将不同来源的数据用不同的方式展示,从而方便对它们进行对比和分析。

Materials Studio

 

Database & Application Int egration

数据库和应用程序整合

● Integration模块提供了强大的集成功能,能够把现有的内部或第三方程序以及数据库无缝集成到Pipeline Pilot中,从而能充分利用现有的计算资源。被整合入

Pipeline Pilot的应用工具可以像系统原有的模块组件一样被方便的使用。本模块支持对Java、Perl、.Net、VBScript等的脚本和程序进行直接整合,也支持通过

JDBC、ODBC整合Oracle、SQLServer等数据库,实现数据的获取、分析处理和生成报告,并能将结果直接存入数据库。

Materials Studio

 

Analysis & Statistics

分析与统计

● Data Modeling模块提供了—整套统计分析工具,包括机器学习和数据建模,统计模型的预测和数据的筛选,以及适用于大数据集的聚类分析工具。利用该模块的组件,用户可以很容易地对数据进行聚类分析、构建贝叶斯模型、递归分割模型、主成份分析和偏最小二乘回归等分析。结合 Chemistry模块还能够基于化学结构进行建模和聚类分析,构建出各种结构-活性关系模型的、进行化合物分类以及自动寻找化合物的最大公共子结构等。

● PipelinePilot的R统计模块将R的 些数据统计和分析方法无缝整合到Pipeline

Pilot中,用户无需编写R脚本语言,仅需通过调用相关组件,就能够进行基于R语言的数据分析和图表生成。

Materials Studio

 

Document Search & Analysis

文档挖掘和分析

● Text Analytics模块提供了很强的文献检索和文本数据挖掘的功能,将文献检索、特征数据提取和表征等步骤整合为一个自动化的流程,可以实现最具挑战性的文本数据挖掘过程。

(Chemical Text Mining)

● ChemMining模块使PipelinePilot具备 “化学智能” 的文本数据分析功能,它能够自动识别出文献中的化学词汇如化学名、药名、IUPAC名、CAS号、分子式等,并能够将化学名自动转换为化合物结构。

● 通过Thomson Reuters Cortellis模块,可以让您使用Pipeline Pilot 流程,以更高效简单的方式来访问Cortellis数据库所提供的海量的、广泛的生命科学数据,并能够将内部数据与之无缝整合。

暂未实现,敬请期待
暂未实现,敬请期待

解决方案

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