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Charmm
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产品简介
Charmm—多粒子系统的分子模拟程序
CHARMM是一个广泛应用于多粒子系统的分子模拟程序,具有一套全面的能量函数,各种增强的采样方法,并支持多尺度技术,包括QM/MM,MM/CG,和一系列的隐式溶剂模型。在生物系统,包括多肽,蛋白质,假体,小分子配体,核酸,脂类和碳水化合物,以及无机材料设计方面有广泛的应用。
主要功能:
● 支持基本的分子动力学计算,包括多种系综、周期性边界条件、多时间步长、简正模分析、能量最小化等基本算法。
● 支持TIP3P、TIP4P、SPC、SPC/E及ST2等水分子模型。
● 支持多种高级算法,包括多种增强采样方法,复杂的reaction coordinate restraints, 路径采样(path sampling), 蒙特卡洛采样(Monte Carlo sampling),路径优化算法及多种分析工具。
● 可处理经验化得能量计算,包括:相互作用能及构象能量、局域最小化、旋转势垒、与时间相关的动力学行为、振动频率等。
● 拥有三个可极化力场相关模块,支持隐式溶剂模型
● 支持量子力学与经典力学混合的QM/MM计算。