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COSMOLOGIC在药物设计领域的解决方案
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COSMOLOGIC在药物设计领域的解决方案

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现代药物设计过程包括基于计算方法发现、研究和修饰生物活性分子。计算机辅助药物设计减少了药物设计周期中的迭代次数,并加快发明和优化过程。此外,它还提供了药物设计过程中发现更新颖的小分子结构的潜力。

由于它基于量子化学,因此COSMOlogic软件可广泛应用于整个有机化学领域。 用户可以将其应用于截然不同的新颖化学领域。

COSMOsim3D和COSMOsar3D使用本地σ-profiles作为描述符。σ-profiles是从量子化学计算得出,描述分子电子表面的特性,而不是化学结构。因此,它们自然允许支架跳跃和寻找活性类似物。本地σ-profiles提供有关以下信息:

● 静电势

● 氢键能

● 疏水相互作用

● 形状

 

排列和活性相似体搜索

使用基于量子化学的分子表面极性,COSMOsim3D是独特的、稳定的基于场的配体-配体比对的方法。COSMOsim3D相似性是配体相似性的有力描述。因此能够在生物等排体和随机对之间进行良好的区分,并允许支架跳跃和寻找活性类似物。

Example for bioisoster screening with COSMOsim3D (PDF)

 

3D-QSAR

局部σ-profiles阵列是一组新颖的分子相互作用场。他们提供了量化虚拟配体-受体相互作用(包括去溶剂化)所需的所有信息。这导致3D-QSAR研究的预测准确性提高,并且在网格步长、网格定位和随机未对准方面具有出色的稳定性。

Example for the predictivity of a COSMOsar3D based 3D-QSAR in comparison to other methods on the Sutherland data set. (PDF)

 

ADME 属性

COSMOtherm或COSMOquick中,分子描述符可从表面极性信息和结构参数中得出。用户可以基于这些有明确物理意义的描述符来构建自己的QSAR模型。许多此类ADME模型可直接使用。

未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加
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