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Materials Studio 2025版来啦!
关键技术要点:
1.停止支持Red Hat Enterprise Linux 8.0、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5以及Windows Server 2016 Essentials;
2.支持Windows 10多会话(multisession)、Red Hat Enterprise Linux 9.x、Rocky Linux 8.6及更高版本、Rocky Linux 9.x;
3.支持Slurm负载管理器23.x;
新功能:
1.Forcite支持MACE学习模型力场;
2.Forcite支持GPU加速,GPU加速支持范德华和静电相互作用计算的“group sum方法”;
3.更新了COMPASS III力场中磷三卤化物、钛酸盐、N-O键和钡离子参数;
4.使用介观尺度(mesoscale)力场构建介观分子的无定形胞;
5.支持Linux平台CASTEP模块GPU加速,大幅加速了非局部交换相关泛函的昂贵计算;
6.CASTEP支持meta-GGA交换相关函数R2SCAN(Furness,2020);
7.CASTEP支持GGA泛函:PBE、PBESOL、RPBE、BLYP的Grimme D3色散校正;
8.FlexTS支持CASTEP模块的最小能量路径模拟,以预测反应路径;
9.DFTB+支持预测振动光谱;
10.根据分子动力学轨迹进行离子簇分析。
增强功能:
1.Amorphous Cell模块大幅提高性能,特别是对于大分子系统;
2.介观结构建模支持运动群(motion groups),允许用刚性和柔性分子填充模板;
3.Grimme D3色散校正现在CASTEP支持GGA泛函:PBE、PBESOL、RPBE、BLYP的Grimme D3色散校正,涵盖了Z=94以下的所有元素,因此可以研究相关锕系化合物;
4.Mesocite包括一个新的Builder工具,使用中分子(mesomolecules)和Mesocite力场构建介观尺度无定形胞。Mesocite Builder基于珠结构的力场进行Mesocite能量和几何优化计算。基于Materials Visualizer和Materials Script,打开介观尺度建模功能,完成新的构造、排列和约束层模型de 建立。
5.Materials Studio平台完全发挥DFTB+功能。坐标、电荷和能量等属性转移到内存中,从而显著提高了对型系统的计算性能;
6.COMPASSIII中新的p3型力场为PF3等磷三卤化物提供了支持;
7.Materials Script API可以为Motion Group定义新特性。Motion Group Atoms和Motion Group Beads属性分别提供运动组原子和珠子的只读性质;
8.Forcete和Mesocite进行NPH或NPT系综计算,直接输出应力和压力图;
9.DMol3的Diels-Alder反应动力学教程使用最小能量路径任务而不是TS搜索任务,演示更准确的反应预测步骤;
10.COMPASSIII中新的力场n3o+在更为准确的描述芳香结构中的N-O键的部分电荷;
11.从3DEXPERIENCE云服务器上运行的Pipeline Pilot协议可靠地下载特大文件;
12.COMPASSIII新型力场ti4o3为钛酸盐结构(如BaTiO3)提供了支持;
13.Conformers教程使用COMPASSIII力场预测更真实的偶极矩;
14.CASTEP利用FlexTS模块进行最小能量路径模拟,预测反应路径;
15.色散校正不支持包含混合原子的无序系统的CASTEP VCA计算;
16.ONETEP杂化交换相关泛函计算,在粗精度和中等精度下计算效率更高;精细精度和超精细精度下尽管速度较慢单计算更准确;
17.DFTB+频率属性计算提供振动光谱;
18.提高径向分布函数的计算性能,特别是对于多原子或珠子的系统;
19.COMPASSIII新力场ba+2为钡离子提供了支持;
20.CASTEP支持meta-GGA交换相关函数R2SCAN(Furness,2020);
21.ONETEP学术版升级到7.1;
22.GULP学术版本升级到6.3;
23.CASTEP的Linux版支持GPU加速,大幅加速了涉及非局域交换相关泛函的昂贵计算;
24.Materials Studio脚本菜单中增加两个新脚本,用聚类总体分析方法计算轨迹中的离子分类,根据热图可视化结果平均聚类;
25.Forcite GPU支持范德华和静电相互作用的Group sum方法;
26.改进CASTEP的OTFG超软赝势描述4f和5f元素设置。基于Bosoni等人的出版物(《自然物理评论》62024年第6期,第45-58页);
27.CASTEP和DMol3弹性系数计算中,引入一种新的晶体弹性各向异性标量对数欧几里得度量;
28.DMol3增加新的教程,说明有效屏蔽介质(ESM)的使用方法;
29.支持构建介观尺度分子时,可以选择随机化分子构象;
30.Mesocite增加新教程,说明如何使用新的Mesocite Builder构建介观尺度聚乙烯的无定形胞;
31.Materials Studio支持Python3.12.4;
32.CASTEP支持超软赝势计算压电系数;
33.Forcite在Nvidia卡获得一致的GPU加速性能;
34.Materials Studio 2025的GateWay支持Red Hat 9.x,其中x大于3;
35.Materials Studio支持MACE类机器学习力场,包括两个新的MACE力场。有关详细信息,请参见Materials Studio联机帮助;
修正功能:
1.CASTEP的大体系、高q矢量的声子频率计算不再因Windows网关上的错误而终止;
2.COMPSSIII支持S=P双键描述;
3.修复了使用查找等效原子工具时,导致撤消有时失败的问题;
4.玻尔兹曼反演脚本现在可以尝试通过使用总量而不是分子内径向分布函数来处理包含无限网络的模型;
5.大于100埃的分子动力学移动会停止计算并显示错误消息,但Granular Dynamics除外,其最大值为一百万埃。这将恢复实施Granular Dynamics之前的遗留行为;
6.Forcite GPU计算中PPPM方法可以可靠地处理原子间距较小的情况;
7.Pipeline Pilot Connector中的Protocol帮助中链接外部URL,可以使用默认浏览器;
8.CASTEP的非共线自旋计算可以正确设置未占据带的数量(考虑简并性的提升);
9.XSD文档导出为CAR格式文件将始终为CAR文件应用正确方向。这种方向变化过去是有条件的,如果变化接近统一,则跳过;
10.CIF格式模型导入,对对称定义的文本语法变化更加宽容;
11.DMol3计算拉曼特性时正确重置几何优化;
12.修订了Windows上使用多核计算DFTB+cosmo文件,并写入失败问题;
13.Mesocite不再偶尔报告与键增量相关的错误;
14.Snapshot Trajectory和Snapshot Study Table关键字的文档和F1查找已得到更正;
15.如果分子质量在两次运行之间发生变化,Amorphous Cell给出正确的密度;
16.MS Martini 3的默认相对介电常数现在设置为15,以便通过Materials Studio Martini 3 Tools更容易生成自定义力场;
17.预测3-氧杂二环(3.2.0)庚-1,4-二烯多晶型物的晶体结构预测教程使用COMPASSIII力场,更准确地预测可能的晶体堆积排列;
18.教程“计算两种聚合物的混溶性”使用COMPSSIII作为力场;
19.预测潜在抗癌药物多态性教程使用COMPASS III力场更准确地预测可能的晶体堆积排列;
20.Blend教程“聚合物混合物相容性筛选”现在基于COMPASS III力场的使用;
21.教程“绘制简单分子”中绘制甲基丙烯酸甲酯的说明已经更新;
22.修正了DFTB+生成电子参数(Generate Electronic Parameters)示例脚本路径名中空格的问题;
23.加载状态文件时,Forcite能量选项卡上的控件可以正确启用或禁用;
24.可以更准确地生成周期性纳米管的键序;
25.解决某些数字微调器控件在非英语区域设置中表现不正确的问题;
26.在大体系CASTEP计算过程中请求极化率IR和拉曼光谱属性时,解决了保存二进制检查文件时,过程停止问题;
27.DMol3和DFTB+中“Minimum Energy Path”对话框的文档,正确地描述指定TS候选的设置;
28.DMol3运行“Minimum Energy Path”任务时,纠正了有效筛选介质真空间隙验证问题;
29.导入某些CIF文件时,Materials Studio不再报告有关未结合氢的警告;
30.调试模式下运行Force GPU脚本,而进程遇到错误时,系统会给出改进信息;
31.Mesocite密度场分析不再间歇性地报告“Permission denied”错误,提供更清晰的错误消息;
32.更新COMPASSIII中分子氢(H2)的键拉伸和范德华参数,提高扩散性能描述准确性;
33.Forcete各向异性恒压器正确地处理方向不标准(C=Z、Y=B、A=X)的结构;
34.DFTB+输运任务检查周期性结构的触点是否沿Z方向;
35.解释不同Materials Studio模块如何支持约束的文档得到了显著改进;
36.肟和硝酸盐中氧原子的COMPASSIII力场类型等效性得到了改进;
37.DMol3分析中,如果遇到因结构缺失Hessians而导致的速率系数计算错误,系统现在会提供给用户一个建议的行动来纠正这个问题;
38.查看GULP力场库时,文本展现会考虑行尾,使显示更容易阅读;
39.检查包含非英语语言环境的特殊字符的Materials Scripts的语法时,不再报告问题;
40.Morphology的Copy Script函数包括Energy Method设置;
41.解决了在过渡态附近采样时扭转角的问题;
42.MaterialsScript可以导入压缩的study table文档和轨迹文档。Microsoft Windows Server 2016不支持此功能;
43.Cantera教程中Laminar预混合火焰使用总和为1的摩尔比值;
44.Granular Dynamics Compression脚本不再报告使用未初始化变量的警告;
45.更准确的描述MS Martini 3力场;
46.纠正当选择各向异性恒压器时,Forcite动力学压力控制有时无法正常工作的问题;
47.MaterialsScript Martini3Tools生成详细报告,包括失败进程的消息;
48.COMPASS III力场改进了磷酸参数;
已知问题:
1.在涉及并行计算的某些情况下,大分子和大基组的DMol3 TD-DFT计算可能会导致整数溢出。解决方法:使用较小的基组或在单个核心上运行;
2.CASTEP TD-DFT计算具有高激发密度大系统的光学性质会产生非物理介电函数和相关的光学性质;
3.导入老版本的Materials Studio XMS设置文件时,有时打开对话框时设置不会保留。解决方法:从以前的Materials Studio版本复制整个文件夹,设置将保留;
4.当用COMPASIII模拟钛酸盐(如钛酸钡)时,必须手动将ti4o3类型分配给钛原子;
License Pack增强功能:
1.BIOVIALicense Pack使用QT 5.15版本;
2.License Pack更新以支持Red Hat Enterprise Linux 9.x。
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