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Materials Studio 2021新版本发布!

Materials Studio 2021新版本发布!

作者:
泰科
2021/04/21
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【摘要】:
Materials Studio 2021增加一系列面向产品研发的新功能,进一步扩展了在热门研究领域的应用能力,包括在新功能材料和能源材料方面。

Materials Studio 2021新版本发布!

Materials Studio 2021增加一系列面向产品研发的新功能,进一步扩展了在热门研究领域的应用能力,包括在新功能材料和能源材料方面。

Materials Studio新增功能

• 新模块FlexTS,FlexTS为DMol3和DFTB+提供了在势能面上找到固定的任务功能,使计算反应路径和与化学反应相关的能垒成为可能。

• Materials Studio Collection基于Pipeline Pilot新增的系列protocols,采用PhaseField计算硬质材料的硬化和晶粒生长。用户可在Materials Studio的Pipeline Pilot Connector中访问Metal Alloy文件夹,并使用上述protocols。Materials Studio提供两个相关案例,介绍上述protocols使用方法。

• Forcite和Mesocite计算中可使用GPU加速,同时可提交GPU任务到任何支持的排队系统中。

 

Materials Studio各模块增强功能

Cantera

Cantera升级到2.4.0版本,Python升级到3.8.1。

 

CASTEP

• 在CASTEP的弹性常数计算结果中加入了Niu等(2019)的材料断裂韧度估算经验模型,预测脆性材料性质。

• CASTEP现可计算孤立分子的溶剂化能。

• 在CASTEP中实现了二次谐波产生系数张量的计算,有助于开发非线性光学材料。

• CASTEP中增加了自发极化的Berry phase计算方法。

• CASTEP中的自旋轨道耦合计算现已扩展到:

(1) 动态产生的norm-conserving赝势。

(2) 光学性质计算。

(3) 支持使用非局域交换关联泛函。

(4) 在Materials Visualizer中设置非共线自旋构型。

 

COMPASS

• COMPASSIII支持与锂离子电池相关的硼化物,例如双(草酸)硼酸盐、二氟(草酸)硼酸盐和吡啶三氟化硼的计算。

• COMPASS (2.8)与cvff_nocross_nomorse力场迁到FORCEFIELDS-LEGACY文件夹。这个文件夹中的力场可以从Forcite Forcefield管理器对话框中导入。COMPASSII已被删除。使用COMPASS或COMPASSII的项目会自动定向到当前版本的COMPASSIII。

 

DFTB+

新的FlexTS功能通过新的Minimum Energy Path任务项添加到DFTB+中。FlexTS是用于构建最小能量路径的工具,包括NEB方法。

 

DMol3

• 通过新的Minimum Energy Path任务项在DMol3中增加FlexTS功能。FlexTS是用于构建最小能量路径的工具,包括NEB方法。

• 在DMol3的弹性常数计算结果中加入了Niu等(2019)的脆性材料断裂韧度估计经验模型。

• DMol3分子动力学现可以使用XSD文件的当前速度作为初始速度。

 

Forcite

• 在Materials Studio forcefields中添加了对Urey-Bradley相互作用和CHARMM反转的支持。

• 为Materials Studio forcefields添加了新的van der Waals函数形式LJ_12_6_14,允许为1-4相互作用指定不同的R0和D0值。

• 可以从Forcite力场管理器导入增强版的cvff力场--cvff_aug。

 

GULP

• GULP升级到6.0版本。周期体系的刚性分子模型支持几何优化、性质和声子计算。

• 新增ReaxFF库--“ReaxFF SEI”。它基于Hossain等的研究报道(J. Chem. Phys., 152, 184301(2020)),旨在描述锂电池电解液和固体电解质界面。

 

ONETEP

• 在ONETEP中实现了一系列的杂化泛函。

• ONETEP隐式溶剂计算扩展到Poisson-Boltzmann方法,把电解质离子作为点电荷,忽略它们之间的相互作用,但影响溶质的筛选。

• ONETEP模块已更新为使用该代码的学术版本6.1.1。

 

Materials Visualizer的增强

所有的.msi格式的示例结构都已转换为.xsd格式。

通过MSC将研究表格和轨迹文件作为单个压缩文件从Materials Studio传输到Pipeline Pilot。

所有基于forcefield的模块添加了一个ReportAutomaticTerms设置,用于打开或关闭使用自动详细信息报告功能。

 

Materials Script的增强

MaterialsScript支持在Forcite和Mesocite计算中使用GPU加速。

MaterialsScript使用的Perl版本已在MaterialsStudio 2021中更新。Perl的更新版本提供了各种新特性,但也对Perl脚本和模块的语法提出了额外的要求。这些附加要求适用于所有新的MaterialsScript脚本。

在Materials Studio客户端运行的MaterialsScript使用Perl5.26.1版本。

• 有关Materials Studio 2021中Perl更改的更多信息,详见 https://perldoc.perl.org/5.30.0/perldelta.html

• 对现有MaterialsScript的更改信息,详见Modified Perl requirements(新版本客户端中的文件)。

 

Materials Studio基础功能的改进

 在所有支持的平台上,Materials Studio Gateway中部署的Apache版本已升级到2.4.46。

• Mozilla XPCOM软件库已经从Materials Studio中移除。

 

BIOVIA License Pack的增强

License Pack现在使用FlexLM 11.16。许可证服务器中的License Pack必须是局域网中的最高版本。确保将License Pack更新到此版本,以保证客户端许可证的核验。

BIOVIA License Pack的Linux安装位置相比2018年及之前版本有所改变,现默认位置为BIOVIA_LicensePack文件夹。

在Linux上安装License Pack 7.6.14或更早版本的BIOVIA License Pack将不再执行先前版本的原位置升级。如果需要继续使用以前的许可证,则需要执行一些附加的安装步骤。有关详细信息,请参阅新版本中 License Pack Online Help

 

教程

新添加了以下教程:

• Calculating the Minimum Energy Path of a molecular switch:介绍了FlexTS结合DMol3和DFTB+来计算和细化一个多步的反应路径。

• PhaseField simulation of grain growth using Pipeline Pilot:演示如何在Materials Studio运行Pipeline Pilot的Materials Studio Collection中的Grain Growth(PhaseField)protocol-晶粒生长protocols。

• PhaseField simulation of solidification using Pipeline Pilot:演示如何在Pipeline Pilot的Materials Studio Collection中运行Solidification(PhaseField)protocol-硬化协议。

下列教程已更新为使用COMPASSIII力场:

• Adsorption Locator:

(1)基于Adsorption Locator确定SO2在Ni(111)表面的吸附位置

(2)模拟抑制剂在颜料红晶体表面上的吸附

• CCDC:在Materials Studio中使用CSD

• Forcite:限制或非限制对称约束条件下尿素的几何优化

• Forcite Plus:

(1)运行受限剪切模拟

(2)计算丙酸在正辛醇中的溶剂化自由能

(3)搜索表面上分子的低能构型

(4)聚合物与金属氧化物表面的相互作用

• Morphology:

(1)颜料红的形态预测

(2)使用Crystal Graph预测形态

• QSAR:设计新的缓蚀剂

• Reflex:基于能量的精修

• Reflex Plus:

(1)Structure solution in the presence of preferred orientation and energetic considerations in structure refinement

(2)Structure solution of 3-chloro-trans-cinnamic acid with Reflex Plus

• Scripting:

使用脚本计算两层之间的相互作用能

• Sorption:

吸附法预测沸石MFI中CH4的吸附

同时更新以下教程:

• Calculating barriers of simple chemical reactions using DMol3's LST/QST and NEB tools: The title of the tutorial has been updated, it was previously "Exploring the minimum energy path of chemical reactions using DMol3's LST/QST and NEB tools".

为帮助运行以下Pipeline Pilot Connector教程而提供的示例文件也已更新:

(1) Cross-linking polymers using Pipeline Pilot

(2) Calculating the stress-strain diagram using Pipeline Pilot

(3) Calculating the glass transition temperature using Pipeline Pilot

 

平台支持

有关Materials Studio系统要求的完整详细信息,请参见System Requirements and Recommendations(新版本客户端中文件)。

 

支持平台添加

服务器端增加了对以下配置的支持:

• Red Hat Enterprise Linux 8.1与8.2

• CentOS 8.1与8.2

排队系统新增以下支持:

• Slurm Workload Manager 20.02.x

为64位Linux和Windows端添加了单GPU计算支持:

CUDA版本10.1、Compute Capability 6.0或更高的NVIDIA卡

 

删除平台支持

服务器端停止支持:

• Windows Server 2012 R2

排队系统停止支持:

• Slurm Workload Manager 18

浏览器停止支持:

• Internet Explorer 11

 

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